DNAシークエンシング実験を一発で成功させるための必読書!

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遺伝子工学実験ノート(下)にはDNAシークエンシングの原理からプロトコールまでわかりやすく図解されています。

  • DNAシークエンスの流れ
  • アイソトープを用いるジデオキシ法(サンガー法)の原理と実験手順
  • オートシークエンサーのセットアップ、ランの開始、データ解析、データの保存、メンテナンス方法

について学べるので、DNAシークエンス実験初心者でもすぐに実験に取り組めます

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DNAシークエンシング実験に関する質問、トラブルシューティングフォーラム

 

 

DNAシークエンス実験とは(ウィキペディア)

DNAシークエンシングの意味とそれに関連する実験手法について丁寧に解説されています。

 

DNAシークエンス法(パワーポイント)

札幌医科大学が公開しているDNAシークエンス法の資料。

DNAシークエンスの原理や手法が図解で解説してあります。

 

 

DNAシークエンス実験のプロトコール

シークエンスプロトコール

九州大学が公開しているプロトコールです。

DNAの精製からシークエンス反応までの一連のプロトコールが書かれています。

 

シークエンスプロトコール

山口大学遺伝子実験施設が公開しているプロトコールです。

シークエンス反応のプロトコールが詳細に書かれています。

 

DNAシークエンスの手法(英語サイト)

米国オクラホマ大学の研究グループが公開しているプロトコール。

バリエーションに富んだDNAシークエンス手法が豊富に掲載されており、非常に参考になります。

 

 

化学分解法によるDNAシークエンスプロトコール

マクサム・ギルバート法によるDNAシークエンスpdf(英語サイト)

米国ノースウェスタン大学の研究グループが公開しているプロトコール。

マクサム・ギルバート法の原理はこちらを参照してください。

マクサム・ギルバート法の原理

DNAの化学分解法シークエンス(英語サイト)

米国ハッチンストン癌研究センターが公開しているプロトコール。

DNAフットプリント法や短いオリゴヌクレオチドのシークエンスに用いられる手法です。

 

 

ジデオキシ法によるDNAシークエンスプロトコール

ジデオキシ法とは

ジデオキシ法について図入りでわかりやすく解説しています。

 

33P ddNTPを用いたDNAシークエンス(英語サイト)

ノルウェーのNTN大学が公開するプロトコール

 

 

ゲノムのシークエンスプロトコール

BACもしくはPACクローンからのDNA単離(英語サイト)

BACもしくはPACに組み込むDNAの調整方法(英語サイト)

米国オクラホマ研究所が公開するプロトコール。

人工染色体(BACやPAC)に関する実験手法。

 

サイクルシークエンス反応によるゲノムDNAシークエンス(英語サイト)

ジョンズホプキンス大学のKathleen.Mらが開発したゲノムDNAシークエンス手法

出典:Murphy, K.; Berg, K.; Eshleman, J. (2005). “Sequencing of genomic DNA by combined amplification and cycle sequencing reaction”. Clinical chemistry 51 (1): 35–39.

 

 

次世代のシークエンス手法

mRNAのシークエンスサンプル調整方法pdf(英語サイト)

米国カルフォルニア大学バークレー校の研究グループが公開しているプロトコール。

mRNAをシークエンス用に調整する手法です。

 

 

シークエンス用DNAの調整方法

シークエンス用DNAの調整法(英語サイト)

米国ユタ大学の研究グループが公開しているプロトコール。

シークエンス用DNA調整時の注意点や具体的な調整手法が解説されています。



関連プロトコール